Với hệ thống này, người chơi có thể lựa chọn một trong bốn nhánh chiến đấu, mỗi nhánh cho phép Kerrigan sử dụng năm khả năng đặc biệt đồng thời điểm tiềm năng cũng được đưa vào. Chỉ có hai nhánh là Spec Ops cùng Corruption xuất hiện trong hai màn chơi mà Blizzard mới tung ra gần đây.
Trong Starcraft II: Heart of the Swarm, Battle Focuses ảnh hưởng đến các chỉ số của Kerrigan gồm: Máu, sát thương, giáp và năng lượng. Mỗi nhánh lại có các loại phép thuật, kĩ năng khác nhau. Người chơi có thể mở khóa thêm trong suốt phần chiến dịch.
Trong game, Kerrigan có thêm hai trợ lý, Abathur cùng Izsha và cô có thể tương tác với họ giữa các màn chơi, trong con tàu Leviathan.
Izsha sẽ có nhiệm vụ giới thiệu qua các màn chơi, những điểm chính cần lưu ý trong nhiệm vụ cũng như trên hành tinh nơi Kerrigan sẽ đổ bộ
Abathur lại trợ giúp về phần tiến hóa cho đoàn quân của Kerrigan với khả năng nâng cấp các đơn vị với những đoạn mã gen thu thập được trong suốt quá trình chơi.
Tại Char, Kerrigan đang quan sát căn cứ Terran dưới sự điều khiển của tướng Warfield, người mà cô đã gặp trong đoạn kết của Wings of Liberty.
Kerrigan nói chuyện với Abathur trong khu tiến hóa của tàu Leviathan, yêu cầu những nâng cấp mới.
Đây là khu vực tiến hóa của Leviathan, nơi tất cả các đơn vị sẽ có mặt để sẵn sàng được điều chỉnh.
Baneling có thể tiến hóa hoặc nâng cấp nhờ các đoạn mã gen như sau:
Nâng cấp
Viscous Discharge – Acid gây chậm đối phương
Centrifugal Hooks – Tốc độ tăng 25%
Rupture – Khu vực ảnh hưởng tăng 25%
Tiến hóa
Splitterling – Biến thành hai Baneling nhỏ sau khi chết, diễn ra hai lần.
Gorgeling – Biến các đơn vị hay công trình bị tiêu diệt thành những khoáng sản có ích.
Roach có thể tiến hóa hoặc nâng cấp theo các hướng sau
Nâng cấp
Chitinous Plating - +1 giáp
Bile Ducts - +2 sức sát thương
Organic Carapace – Hồi máu nhanh hơn trong quá trình chui xuống hoặc trồi lên khỏi mặt đất
Tiến hóa
Prowler – Có thể di chuyển khi chui xuống đất
Leech – Mỗi lần tiêu diệt kẻ thù sẽ nhận được 10 máu (tối đa là 60). Hồi máu nhanh hơn khi ở dưới đất.
Zergling có thể tiến hóa hoặc nâng cấp theo các hướng sau
Nâng cấp
Metabolic Boost – tốc độ di chuyển tăng 33%
Posthumous Mitosis - 20% cơ hội chuyển thành Broodling khi chết
Rapid Genesis – Zergling sẽ ra đời ngay lập tức
Tiến hóa
Swarmling – Lava sẽ nở ra 3 Zerling thay vì hai, với số tiền giữ nguyên
Raptor – Nhảy vào đối thủ, có thêm 10 máu.
Một Zergling tiến hóa thành Swarmling.
Trên hành tinh Kaldir, nơi quân Protoss vừa đổ bộ, Kerrigan cùng hai trợ lý bàn bạc về nhiệm vụ.
Kerrigan nói với Izsha về Na'Fash dưới sự chỉ huy của một Zerg Queen phản loạn.
Tại Char, Kerrigan phải nhanh chóng thu thập trứng Baneling trước Za'gara. Char lúc này chỉ có Infested Terran và Zerg. .
Kerrigan chỉ huy Banelings và Swarmlings
Kerrigan cho Banelings tấn công căn cứ của Za'gara.
Char chìm trong những biển acid cùng loài Zerg.
Căn cứ của Za'gara's. Za’gara không thể bị tiêu diệt, nó sẽ nhanh chóng hồi sinh sau 5 phút từ khi bị đánh bại.
Baneling nở ra từ những trứng thu thập được.
Kerrigan chỉ huy Zerglings cùng Banelings chống lại những sinh vật Zerg hoang dã, thu thập trứng của chúng.
Hàng trăm Banelings và Zerglings được sinh ra từ Birthing Pool. Za'gara cùng bốn Hydralisk hoàn toàn bất lực.
Kerrigan tấn công một nhóm người tuyết với Zergling cùng Roach.
Tại Kaldir, Protoss chống lại khí lạnh bằng cách mở rộng giáp năng lượng.
Những sinh vật hoang dã cùng người tuyết tấn công Kerrigan.
Một trạm liên lạc của Protoss bị tiêu diệt.
Quân Zerg bị đóng băng trên Kaldir trước khi có được DNA của người tuyết.
Kerrigan cùng một nhóm Roach và Raptor
Yeti tấn công quân của Kerrigan.
Zerg tấn công khi quân Protoss bị đông cứng.
Một căn cứ Protoss trên Kaldir.
Khí lạnh khiến hoạt động bị ngưng trệ
Broodlings tấn công một căn cứ của Protoss. Người chơi phải phá hủy các trạm phát sóng để hoàn thành nhiệm vụ.
Giới thiệu màn chơi, nhiệm vụ, phần thưởng, các đơn vị mới.
Hành tinh Char nhìn từ ngoài vũ trụ.
Kaldir, một hành tinh Hoth trong thế giới Starcraft.