Không giống như người anh em FIFA Online 2, FIFA Online 3 được đánh giá khá cao về hệ thống điều hành game. Cho tới thời điểm hiện tại vẫn chưa có dấu hiệu xuất hiện bất cứ trường hợp sử dụng phần mềm thứ 3 nào can thiệp ingame (hay còn gọi là hack game).

Tuy nhiên, FIFA Online 3 vẫn có một điểm trừ không hề nhỏ đó là thường xuyên để xảy ra các bug, mặc dù nó không gây ra hậu quả nghiêm trọng như tool hack nhưng cũng đủ khiến các game thủ cảm thấy bức xúc khi gặp phải.

Trước đây là lỗi trận đấu "bất tận" (thời gian biến mất, không game thủ nào chạm được vào bóng và bị buộc phải thoát ra chịu trận thua 0-5). Và bây giờ tiếp tục là một lỗi có phần tương tự. Cụ thể, trong khoảng 4, 5 hôm trở lại đây rất nhiều người chơi đã gặp phải tình trạng cứ chơi trận đầu tiên là bị mất kết nối, xử thua 0-5.

Chia sẻ về vấn đề này, game thủ thedaity bức xúc nói: "Tình hình là khoảng 4 hôm nay mình đăng nhập vài Fifa Online 3 đá trận đầu tiên được mấy phút thì lại bị văng ra ngoài, xử thua 0-5 ức không thể tả nổi. Mà hình như cứ lần đầu tiên đăng nhập thì mới bị chứ văng ra xong đăng nhập lại chơi rất bình thường. Mong NPH sớm tìm hiểu".

Theo tìm hiểu của chúng tôi thì lỗi này không phải xảy ra đối với toàn thể cộng đồng FIFA Online 3 nhưng cũng không phải chỉ xảy ra với một bộ phận nhỏ. Trước đây khi không biết nguyên nhân, nhiều game thủ đã phải "đập nát bàn phím" khi trót vừa đăng nhập đã đá xếp hạng hay đá cup ngay (bị văng ra ngoài, trừ điểm, mất lượt đấu cup).

Khi đã "quen mùi" tất cả đều chơi một trận "giao hữu" để chịu một lần văng ra ngoài cho xong đi đã. Sau đó đăng nhập lại và bắt đầu thi đấu chính thức. Theo chia sẻ của ban quản lý thì đây chỉ là bị đứt kết nối bất ngờ và hứa sẽ sớm khắc phục trong thời gian sớm nhất.